https://frosthead.com

Kuidas teadlased otsustavad, millist looma genoomi järjestada

Mis ühist on Aafrika küünistega konnad, orangutangid ja kitsed? Geneetikud on vaadanud sügavalt, sügavalt oma geenidesse: nende liikide kogu genoom on järjestatud.

Seotud sisu

  • Mis selles tuunirullas tegelikult on? DNA-testimine võib aidata teil seda välja selgitada
  • Mida tähendab olla liik? Geneetika muudab vastust
  • Need on väljasurnud loomad, keda võime ja peaksime uuesti üles tooma

Võib-olla olete kuulnud võimalusest kogu oma genoom sekveneerida. Mõni aasta tagasi langes inimese genoomi sekveneerimise hind 1000 dollarini. See ei ole taskuvahetus, kuid see pole ka 2, 7 miljardit dollarit, mis läks maksma inimese esimese genoomi järjestamiseks. Loomadega on see aga keerulisem. Kuna ühtegi teist selle liigi sugu pole kunagi järjestatud, on genoomi keerulisem ilma viideteta kokku panna.

Ümarussist C. elegans sai esimene loom, kelle genoom sekveneeriti 1998. aastal. Sellest ajast alates on genoomi sekveneerimise parem tehnoloogia võimaldanud teadlastel liikuda oluliselt keerukamate organismide juurde ning sekveneerida palju kiiremini ja tõhusamalt.

Kuid on endiselt ebatõenäoline, et teadlased järjestavad kunagi iga looma genoomi. Nad peavad valima ja valima. Kust siis alustada?

Selle otsuse vastuvõtmiseks pole ühtegi kriteeriumi. Mõnikord suurendab see teadlikkust liikidest ja nende potentsiaalsest kasust inimkonnale: see oli põhjus, miks Singapuri Riikliku Ülikooli teadlased taotlesid selle aasta alguses templitänava rästiku genoomi järjestamiseks rahastamist, kirjutab Samantha Boh ajalehele Singapore Times . Rästik on "ainus madu liik, kes teadaolevalt toksiini nimega waglerin toodab", kirjutab ta - "neuromuskulaarne inhibiitor, mida teadlaste arvates võiks arendada lihaseid lõdvestavaks ravimiks".

Lisaks genoomi järjestamise potentsiaalsetele meditsiinilistele eelistele on ka tava, mis on oluline maailma teadusliku ja ajaloolise mõistmise jaoks. „Elavate liikide genoomis asuvad ajaloolised jäljed adaptiivsetest sündmustest, mis viisid nad sinna, kus nad on täna, “ ütles genoomilise mitmekesisuse laboratooriumi juhataja Stephen O'Brien konverentsil.

Loomade praeguste genoomide uurimine võib teadlastele rääkida nende minevikust liigina ning keskkonna kohta, kus nad on elanud, ja teistest liikidest, kes on nendega koos elanud. Näiteks kodustatud loomade genoomid võivad aidata inimkonna minevikku selgitada. Nii inimesed kui ka loomad, nagu lehmad ja sead, muutusid (ja muutuvad endiselt), kui osa inimkonnast asus elama ja asus loomakasvatusse. Uurides, kuidas nad kodustatud kujul arenesid, aitab geneetikud mõista muistse inimese evolutsiooni tegureid ja see aitab selgitada, millal loomad täpselt kodustati.

Nendel koduloomade genoomidel on palju pakkuda ka inimkonnale. „Täpsed referentsgenoomid on olulised organismi bioloogia mõistmiseks, tervise ja haiguste geneetiliste põhjuste tundmaõppimiseks ning loomadel aretusotsuste tegemiseks, “ öeldakse Riikliku Inimese Geenivaramu Uurimisinstituudi pressiteates.

Mõnikord aitab looma genoomi järjestamine teadlastel teravaks jääda. Kanada teadlased, kes tavaliselt töötavad inimese genoomi kallal, sekveneerisid kopra genoomi selle aasta alguses Kanada 150. sünnipäeva tähistamiseks. "Suurem osa meie jõupingutustest on suunatud inimgenoomidele, " rääkis teadlane Stephen Scherer mulle. "Kuid see stimuleerib meid intellektuaalselt vaatama kaugemale sellest, mida teeme." Ei teinud haiget see, et kobras on Kanada riiklik sümbol. Sest mõnikord on head suhtekorraldus sama hea põhjus kui mis tahes muu.

papadum_goat.jpg Papadum, San Clemente kits, kelle genoom rekonstrueeriti uue tehnika abil selle aasta alguses. (Brian L. Sayre)
Kuidas teadlased otsustavad, millist looma genoomi järjestada