https://frosthead.com

Tardigraadid õhutavad vaidlusi ja tutvustavad teadust tegevuses

Pole kahtlust, et mikroskoopilised veeselgrootud, kes on tuntud tardigraadidena, sambla põrsad või vesikarud, on imelikud. Kummaliselt imetlusväärsed kriitikud võivad teiste vaadete hulgas elada kosmose vaakumis, taluda põua kuivamist ja pärast külmumist elada. Värske uuring viitas sellele, et tardigraadid on ka geenivarustajad - et nende genoomides on rohkem sõltumatute taimede, bakterite ja muude mikroobide DNA-d kui ühelgi teisel Maal asuval loomal, teatas Rachel Nuwer hiljuti Smithsonian.com- ile. Teadlased väidavad, et see võime võib isegi selgitada, miks tardigraadid on nii vastupidavad.

Kuid umbes nädal pärast seda üllatuslikku avastust on teine ​​grupp avastused vaidlustanud, teatab Ed Yong The Atlantic'ile . Kiire edasi-tagasi sõitmine kahe meeskonna vahel näitab, kui reageeriv ja potentsiaalselt ennast korrigeeriv teadus võib digiajastul olla.

Põhja-Carolina ülikoolis töötavast esimesest uuringust selgus, et üks tardigraadiliik kannab ilmatu 6600 geeni, mis kuulusid algselt teiste kuningriikide organismidele - enamasti bakteritele, aga ka seentele, taimedele, viirustele ja arhaeale ning mis olid omandatud protsess, mida nimetatakse horisontaalseks geeniülekandeks. Need leiud tähendasid, et Hypsibius dujardini genoom koosneb umbes 17, 5 protsendist võõr-DNA-st, teatas meeskond ajakirjas Proceedings of the National Academy of Sciences . Kuna mõned võõrad geenid on seotud teiste organismide stressireaktsioonidega, kahtlustavad teadlased, et nad võisid tardigraadid anda mõnele oma ainulaadsele võimele ekstreemsetes ilmastikutingimustes ilmneda.

Ent teine ​​rühm Edinburghi ülikoolist järjestas ka samu tardigrade liike ja sai väga erinevaid tulemusi. Need teadlased leidsid, et kriitikul on horisontaalselt üle kantud geene vahemikus 36 kuni 500 - palju väiksem protsent. Kui UNC paber välja tuli, ei olnud Edinburghi tulemusi veel avaldatud, kuid teadlased otsustasid avaldada oma järeldused eeltrükiserveris bioRxiv.org - veebisaidil, kus käsikirjad saab avaldada enne nende ajakirjale saatmist ja vastastikuse eksperdihinnangu. teadusuuringud.

Edinburghi grupp kahtlustab, et ÜRO rühmitus võis "sekveneerida DNAd bakteritest, mis elasid tardigraadide ääres, ja vaatamata nende parimatele pingutustele on nende mikroobide geenid eksinud tõeliste tardigrade geenide vastu", kirjutab Yong. Kuid kuidas oleks võinud esimeses rühmas eksida, kui nad tõesti on? Yong selgitab, et genoomide järjestamise tehnoloogia hõlmab DNA tükeldamist väikesteks tükkideks ja bittide kokkupanekut sidusaks pildiks. Mõni saastumine võib kergesti sisse libiseda, nii et teadlased püüavad välja selgitada, millised bitid kuuluvad uuritavale organismile, mitte läheduses asuvatele mikroobidele.

Edinburghi rühm mõistis, et mõned DNA fragmendid olid teiste fragmentidega võrreldes haruldased. "Bioloogiliselt ei saa seda kuidagi olla, need võivad kuuluda samasse genoomi, " räägib meeskonna juht Mark Blaxter Yongile. Rühm jõudis järeldusele, et tardigrade genoomis on 500 geeni, mis võisid pärineda muudest allikatest, kuid neil on kindlaid tõendeid ainult 36 neist. See annab tardigraadile looma tüüpilisema osa võõrast DNA-st.

Kommentaaris uusimale paberile märgivad Thomas Boothby ja Bob Goldstein UNC-st, et nad olid sellest potentsiaalsest probleemist teadlikud ja tegid kõvasti tööd selle nimel, et see ei mõjutaks nende tulemusi - kuid eksimisvõimalusi on alati. Nad lisavad, et enne täiendavate kommentaaride tegemist teevad nad täiendava analüüsi. Teadlaste sõnul hindasid nad ka konkurentide otsust avaldada vastuolulised tulemused nii kiiresti veebisaidil bioRxiv.org .

Tunded olid vastastikused. Sujai Kumar Edinburghi meeskonnast ütles Yongile, et kui ÜRO rühm ei oleks nende andmeid viivitamata avaldanud, oleks see olnud nende rühmale keerukam. "Ilmselge on teaduse hämmastav uus võime kiiresti iseennast parandada, " räägib Blaxter Yongile. See, mis sel juhul võttis kõigest üheksa päeva, oleks möödunud mitu kuud.

Žürii on praegu veel otsustanud, kui suur osa tardigraadi genoomist pärineb välismaistest allikatest. Kuid isegi kui need pisikesed olendid pole geenivarustajad, võivad nad mõnda aega kauem pea peal olla.

Toimetajate märkus: Selle artikli on toimetanud Rachel Nuwer, kes algselt teatas Smithsonian.com-i tardigrade uuringutest.

Tardigraadid õhutavad vaidlusi ja tutvustavad teadust tegevuses