Indoneesia on kahe silma vahele jäänud professionaalse paleoantropoloogia sünnikoht. Euroopas avastasid teadlased 19. sajandi keskpaigas esimest korda väljasurnud hominiidiliiki: neandertallased. Tegelikult on täpsem öelda, et neandertaallaste fossiilid leidsid võhikud, kes juhtisid neid tuntud anatomistide tähelepanu all. Alles 1890 asus teadlane põllule otsima hominiidi luid. Hollandi meedik Eugene Dubois reisis Indoneesiasse, seejärel Hollandi kolooniasse, esivanemaid otsima. Aastal 1891 avastas ta Homo erectuse fossiilid ja pani hominiidijahtimise heaks ettevõtmiseks - ning tegi Aasiast paleoantropoloogide sihtkoha.
Trinil: Duboisi avastused leidsid aset Java keskosas Trinili küla lähedal. Tema esimene leid oli pealuu, nüüd teada 700 000 kuni 1 miljon aastat tagasi. Kolju nägi välja inimlik, kuid sellel olid paksud luud, rasked kulmud ja madal, kaldus otsmik. Aasta hiljem, 1892. aastal, taastas Dubois peaaegu täieliku reieluu, mis nägi välja peaaegu tänapäevane. Ta otsustas, et luud kuulusid väljasurnud liikidele, mis olid inimahvide ja inimeste vahel puuduvaks lüliks. Ta nimetas liigi Pithecanthropus erectus (“püstine ahvimees”). Mõnikord nimetatakse seda Java Maniks, tänapäeval nimetatakse seda liiki Homo erectus .
Ngandong: Hollandi teadlased avastasid 1930ndatel Jaavas Solo jõe ääres Ngandongi küla lähedal rohkem H. erectuse fossiile, esindades 15 isendit. Alles hiljuti arvasid paleoantropoloogid, et Ngandongi luud esindasid väga hiljutist H. erectuse populatsiooni. Need hominiidid, mis olid võib-olla juba 30 000–50 000 aastat tagasi, võisid olla neandertallaste ja tänapäevaste inimeste kaasmaalased Euroopas ja Lääne-Aasias. Kuid uuemad välitööd ja tutvumisanalüüsid viitavad sellele, et Ngandongi hominiidid elasid palju varem, millalgi vahemikus 143 000 kuni 546 000 aastat tagasi.
Mojokerto: 1936. aastal lõi Hollandi geoloogiakeskusega töötav abiline Jaava idaosas kahe- kuni kolmeaastase lapse osalise koljuosa. Meeskonna liige Ralph von Koenigswald, saksa paleontoloog, tunnistas kolju varajase hominiidi H. erectus kuuluvaks. Ehkki fossiili täpses asukohas ja seetõttu vanuses on viimastel aastatel kahtluse alla seatud, arvavad teadlased, et Mojokerto kolju pärineb umbes 1, 8 miljonist aastast. See teeb sellest ühe vanima hominidi luu, mida kunagi väljaspool Aafrikat leitud.
Sangiran: Aastatel 1937–1941 leidis von Koenigswald Java keskosas Sangirani leiukohas täiendavaid H. erectuse fossiile. Leiud sisaldasid kolme osalist kolju, osalist lõualuu ja kümneid isoleeritud hambaid. Need fossiilid, mis pärinevad enam kui miljon aastat tagasi, aitasid kinnitada H. erectuse liikide staatuse kehtivust. Täna saavad turistid külastada fossiilseid paiku, kus asuvad käimasolevad väljakaevamised, aga ka muuseumi.
Flores: Indoneesia viimane hominiidide avastus oli suur šokeerija. 2004. aastal teatas rühm Indoneesia ja Austraalia teadlasi, et nad on Indoneesia Florese saarelt leidnud ebatavalise fossiilide kollektsiooni. Luud kuulusid väikese ajuga hominiididele, mis olid vähem kui neli jalga pikad ja kaalusid alla 70 naela - kuid mõned fossiilid olid vaid 17 000 aastat vanad. Teadlased otsustasid, et hobikott kuulub uude liiki Homo floresiensis . Kui liigi esivanem ehk H. erectus saarele saabus, kujunes hominiid väiksemaks saarel elamiseks kohanemiseks. Kriitikute sõnul on Hobbit tegelikult siiski tänapäeva inimene, kellel on mingisugune kasvuhäire.
