https://frosthead.com

Algab ambitsioonikas projekt 1,5 miljoni liigi genoomide järjestamiseks

Eelmisel nädalal käivitas ülemaailmne teadlaste konsortsium ametlikult projekti Earth BioGenome. Nagu ütles Kate Kelland Reutersi teatel, nimetavad toetajad ulatuslikku algatust järgmiseks bioloogia kuuvarjutuseks. Arvatakse, et see maksab 4, 7 miljardit dollarit, selle eesmärk on järjestada 1, 5 miljoni teadaoleva eukarüootsete liikide või keerukate eluliikide DNA Maal. . Nii paljude liikide DNA-kaardi omamine muudab teadlaste sõnul bioloogilisest, ökoloogilisest ja bioloogilisest mitmekesisusest teadmatut.

Pressiteate kohaselt alustab projekt Wellcome Sangeri instituudi uue jõupingutusega, mille nimi on Darwini elupuu projekt, mille eesmärk on järjestada kõik järgmise kümne aasta jooksul Suurbritannias leitavad 66 000 eukarüootset liiki. Kokku on projektiga liitunud 17 asutust kogu maailmas, sealhulgas Smithsonian, kes tutvustavad oma plaane lähitulevikus.

Praegu on teadlased järjestanud vaid umbes 3500 keerulise eluviisiga liigi genoome ja vaid umbes 100 on järjestatud „võrdluskvaliteediga”, mida kasutatakse põhjalikes uuringutes. Sellesse loendisse kümnete tuhandete genoomide lisamine pole midagi revolutsioonilist.

"Me räägime uutest ravimitest, uutest kütustest tulevikuks, " räägib Sanger Trusti esindaja Julia Wilson Victoria Gillile BBC-s. "Me oleme hetkel piiratud oma kujutlusvõimega - me ei suuda isegi ette kujutada, mida see meile ütleks."

Ambitsioonikas idee tuli esmakordselt kokku 2015. aastal koosolekul, mida juhtis California ülikoolis tegutsev Harry A. Lewin, Davise väljapaistv evolutsiooni ja ökoloogia professor; Gene Robinson, Illinoisi Carl R. Woese ülikooli genoombioloogia instituudi direktor; ja W. John Kress, teadus-botaanik ja Smithsoniani Riikliku Loodusmuuseumi kuraator.

Teadlasi inspireeris inimgenoomi projekt. Kui 2003. aastal oli inimgenoomi ajaloolise järjestamise jaoks kulunud kümmekond aastat ja see läks toona maksma umbes 3 miljardit dollarit (mis, kui arvestada inflatsiooni, läheks tänapäeval maksma hinnanguliselt viis miljardit dollarit), vähendas tohutu pingutus dramaatiliselt järjestamisteenuste maksumus. See asetab selle tohutu projekti võimaluse piiridesse.

Kui see valmib, siis arvatakse, et Earth BioGenome Project hakkab tootma eksabaidi andmeid ehk 1 miljard gigabaiti, mida jagatakse veebis tasuta.

Raske öelda, milleni geeni kaardistamine viib. "Lüngad meie teadmistes on palju suuremad kui see, mida me teame, " räägib Lewin BBC-le. “Nii et me ei täida isegi pusletükke; suurem osa pusle on tühi. ”

Kuid nagu juhib Wellcome Trusti teadusdirektor Jim Smith, sama juhtus ka siis, kui teadlased asusid veerand sajandit tagasi esimest korda tööle inimese genoomi projekti juurde. "[W] e ei osanud ette kujutada, kuidas tollal toodetud DNA järjestus muudab teadusuuringud inimeste tervise ja haiguste tänapäevaks, " ütleb Smith. "Kogu Maakera elu järjestamise missioon on erinev."

Algab ambitsioonikas projekt 1,5 miljoni liigi genoomide järjestamiseks