https://frosthead.com

DNA koodi purustamine

Ekspeditsioonimeeskond ei osanud oodata, et vesi on nii kõrge või et kavandatud marsruudi viimane osa üle kitsa kanali on läbimatu. Teadlased peavad saare kaguosasse pääsemiseks ja isendite kogumiseks minema rändama üle lahtiste okste toorsilla.

Seotud sisu

  • Sipelgate varjatud maailm

"Põhimõtteliselt seisame me troopilises metsas, " ütleb botaanik John Kress. Mõnusas kuumuses rullus ta valge kleidisärgi varrukad üles. Ta haarab väikese puuharu ja viib selle Burgundia lilled lähemale. "Mul on tunne, nagu oleksin Costa Ricas, " ütleb ta.

Metsast väljub kõrge kõlaga vile. Kressi kolleeg, botaanik Dave Erickson küsib naljatledes, kas see on Kesk- ja Lõuna-Ameerikas elav uljur-ahv.

"See on ükskõik, mida soovite, et see oleks, " ütleb Kress.

Plummersi saar, Potomaci jões asuv 12-aakri suurune pisarakujuline maamurd - vaid veidi üle kümne miili Kressi kontorist Smithsoniani loodusmuuseumi rahvusmuuseumis - on umbes sama puutumatu ja ebatõenäoline, et seda maastikku võib leida Washington, DC Beltway. Rahvuspargiteenistuse omanduses alates 1961. aastast on Plummers ka Põhja-Ameerika põhjalikumalt uuritud saar. Ja tänu Kressile ja tema kolleegidele on see esimene koht maailmas, kus kõik 250 taimeliiki on vöötkoodiga.

Kanada vöötmehe Paul Heberti ajulaine DNA vöötkood on modelleeritud vastavalt tarbijapakenditel leiduvale universaalsele tootekoodile (UPC). Igal UPC-l on number, mis tähistab tootjat (näiteks karastusjookide tootjat) ja konkreetset tootetähist (dieet, kofeiinivaba jne). Hebert leidis loomse DNA segmendi, mis on ühine kõikidele liikidele (tootmiskood) ja varieerus loomaliikide vahel (tootetähis). Kuid teadlastel on olnud keerulisem aeg leida taimede jaoks normeeritud DNA segment.

Alustades viis aastat tagasi, kogus Kressi uurimisrühm Plummersi saarel kõigi taimeliikide proove. Seejärel määrasid Erickson ja teised botaanikalaboris igaühe DNA järjestuse. Sealt edasi asusid nad kolmes geneetilises tsoonis - kahes geenis ja geenidevahelises speisseris -, mis koos taimi eristada suutsid. Koos teiste botaanikutega on Kress ja Erickson keset ametlikku protsessi, et saada markerid tavapäraseks vöötkoodiks. Kress loodab saada ametliku heakskiidu aasta jooksul elu vöötkoodi konsortsiumilt - projekt, mis loodi 2004. aastal, et koostada koodide teatmik.

Kuni viimase ajani vajasid taksonoomid taime klassifitseerimiseks taime lilli või puuvilju, st nad pidid proovid koguma kindlatel aastaaegadel. Kuid DNA triipkoodiga saavad nad selle tuvastamiseks kasutada mis tahes taimeosi - seemneid, koort, juuri või lehti.

"Kuid suurim eelis on see, et te ei pea olema ekspert, " ütleb Kress. Mitte nii kauges tulevikus on isegi koolilastel võimalik taimi käsitsi DNA-sekveneerijatega tuvastada. Seejärel võiksid nad nutitelefonide kaudu vöötkoodid veebipõhisesse entsüklopeediasse üles laadida, kus oleks põhitõed liigi, botaanilise kunsti ja anekdootliku teabe kohta. Toidu- ja ravimiamet võiks kasutada taimsete toidulisandite testimiseks vöötkoode; USA toll ja piirikaitse võiksid seda kasutada kahtlase impordi tuvastamiseks.

Erickson on leidnud taimede DNA ka Plummersi saare kümne erineva putukate maapealsetest sisikonnast. Ta soovib paremini mõista, millised putukad on spetsialistid, st nad söövad teatud taimeliike ja millised generalistid, kes söövad peaaegu kõike.

"Olen leidja ja jahvata neid tüüpe, " ütleb Erickson, muutes tavalise botaanilise läga kiituseks. Taimetoitlane Kress pöörab pilku nördinult.

"Te pole kindlasti spetsialist, " kiusab Erickson, tilgutades erkrohelise rööviku pisikesse proovikotti. "Sa oled üldmees. Ma olen näinud, et sa sööd."

Botaanikud John Kress ja Dave Erickson on veetnud viis aastat Plummersi saare 250 taimeliigi DNA järjestuste kogumisel ja triipkoodil. (Stephen Voss) "Nüüd on võistlustel väljas, " räägib botaanik Dave Erickson Plummersi saarel 250 taimeliigi triipkoodiga projektist. (Stephen Voss) DNA vöötkood on modelleeritud vastavalt tarbijapakenditel leiduvale universaalsele tootekoodile (UPC). (Stephen Voss)
DNA koodi purustamine